{"id":23149,"date":"2022-05-11T10:28:03","date_gmt":"2022-05-11T08:28:03","guid":{"rendered":"https:\/\/www.idisantiago.es\/?p=23149"},"modified":"2022-05-11T10:53:37","modified_gmt":"2022-05-11T08:53:37","slug":"la-plataforma-transcriptomica-mas-avanzada-ya-esta-en-el-idis-y-permite-analizar-la-expresion-de-genes-de-cualquier-muestra-biologica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/la-plataforma-transcriptomica-mas-avanzada-ya-esta-en-el-idis-y-permite-analizar-la-expresion-de-genes-de-cualquier-muestra-biologica\/","title":{"rendered":"La plataforma transcript\u00f3mica m\u00e1s avanzada ya est\u00e1 en el IDIS y permite analizar la expresi\u00f3n de genes de cualquier muestra biol\u00f3gica"},"content":{"rendered":"<ul>\n<li>El Instituto de Investigaci\u00f3n Sanitaria de Santiago de Compostela, IDIS, adquiere tecnolog\u00eda de vanguardia para \u2018transcribir\u2019 la parte funcional del genoma, que ejecuta las funciones en el cuerpo de un ser vivo<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong><em>\u00a0<\/em><\/strong><\/p>\n<p><strong>Santiago de Compostela, 05 de mayo de 2022.<\/strong> El IDIS cuenta ya con una Plataforma transcript\u00f3mica, con tecnolog\u00eda Nanostring n-Counter Max, m\u00e1s moderna que la anteriormente existente. La m\u00e1quina ha sido adquirida por el IDIS a trav\u00e9s del grupo de investigaci\u00f3n liderado, Antonio Salas Ellacuriaga y Federico Martin\u00f3n Torres. Ambos investigadores del IDIS apostaron hace m\u00e1s de diez a\u00f1os por desarrollar en su grupo de investigaci\u00f3n el an\u00e1lisis de la expresi\u00f3n de los genes y adquirir para ello la tecnolog\u00eda necesaria. Gracias a esta nueva plataforma transcript\u00f3mica, el grupo de investigaci\u00f3n se sit\u00faa en la vanguardia tecnol\u00f3gica y puede ofrecer este servicio a nivel nacional e internacional, tanto interna como externamente.<\/p>\n<p>El equipo de investigaci\u00f3n liderado por Salas y Martin\u00f3n, con m\u00e1s de dos d\u00e9cadas de experiencia en el an\u00e1lisis del genoma, detect\u00f3 la necesidad de desarrollar esta tecnolog\u00eda a nivel nacional para el an\u00e1lisis de la expresi\u00f3n de los genes. El objetivo es, en palabras de Salas, \u201c<em>analizar las muestras biol\u00f3gicas con una visi\u00f3n integral, que nos permita leer no solo lo que est\u00e1 escrito en nuestros genes, que al fin y al cabo no deja de ser un libro de instrucciones, sino c\u00f3mo todas esas instrucciones se traducen realmente en biomol\u00e9culas que tienen una funci\u00f3n real en el cuerpo humano cuando \u00e9ste se somete a distintos factores ambientales, tan variados como la nutrici\u00f3n, un pat\u00f3geno, el deporte, sustancias t\u00f3xicas, o un est\u00edmulo externo como la m\u00fasica.<\/em>\u201d<\/p>\n<p>Entre los proyectos m\u00e1s destacados desarrollados con estas plataformas est\u00e1n los relacionados con enfermedades infecciosas y vacunas para la COVID-19 o la tuberculosis, as\u00ed como proyectos en el \u00e1mbito del c\u00e1ncer. Como ejemplo del potencial de la t\u00e9cnica, el grupo de investigaci\u00f3n pudo analizar recientemente la expresi\u00f3n g\u00e9nica comparada de muestras de pacientes con COVID-19 en saliva, mucosa nasal y sangre, que solamente pod\u00edan haberse analizado usando estas plataformas.<\/p>\n<p>Este estudio, liderado \u00edntegramente por los investigadores del IDIS, acaba de ser publicado en la revista internacional <em>Environmental Research (<\/em><a href=\"https:\/\/www.sciencedirect.com\/science\/article\/pii\/S0013935122002171\"><em>https:\/\/www.sciencedirect.com\/science\/article\/pii\/S0013935122002171<\/em><\/a><em>)<\/em>. Los investigadores detectaron un conjunto de genes y v\u00edas espec\u00edficas de tejido correlacionados con la gravedad de la COVID-19. Esa gravedad a nivel sist\u00e9mico depend\u00eda de la respuesta inmunitaria del epitelio nasal, y la cavidad bucal podr\u00eda desempe\u00f1ar un papel clave en la diseminaci\u00f3n de infecciones corporales en casos graves.<\/p>\n<p>La tecnolog\u00eda estrella del grupo es el <em>Nanostring n-Counter Max<\/em>. Hasta hace poco tiempo s\u00f3lo se pod\u00eda analizar la expresi\u00f3n de los genes en muestras que poseen una cantidad adecuada del material gen\u00e9tico a analizar y de alta calidad. Esta nueva tecnolog\u00eda, sin embargo, permite analizar el material gen\u00e9tico de casi cualquier tipo de muestra biol\u00f3gica. El grupo de investigaci\u00f3n, dirigido por Salas y Martin\u00f3n, pone desde hace tiempo a disposici\u00f3n de la comunidad cient\u00edfica las plataformas que su grupo gestiona y que representan una oportunidad a la comunidad cient\u00edfica gallega.<\/p>\n<p>Martin\u00f3n destaca que \u201c<em>este desarrollo tecnol\u00f3gico alcanza no solo el \u00e1mbito de la investigaci\u00f3n, sino que tambi\u00e9n estamos desarrollando ideas en el marco diagn\u00f3stico. En poco tiempo estaremos en condiciones de ofrecer soluciones diagn\u00f3sticas para algunas enfermedades, soluciones que se pueden aproximar mejor desde la expresi\u00f3n de los genes que desde los propios genes, y que pueden revolucionar nuestra capacidad de diagn\u00f3stico rutinario en el campo de las enfermedades infecciosas e inflamatorias.<\/em>\u201d<\/p>\n<p>Para el desarrollo de esta plataforma, el equipo de investigaci\u00f3n ha adquirido tambi\u00e9n plataformas complementarias para llevar a cabo la secuenciaci\u00f3n de nueva generaci\u00f3n (<em>Next Generation Sequencing<\/em>), y que facilitan el an\u00e1lisis de genomas humanos enteros, tanto para la expresi\u00f3n g\u00e9nica como para el estudio del genoma. Seg\u00fan Salas, \u201c<em>no se trata solamente de adquirir la tecnolog\u00edas sino que, para ponerla a andar, es importante desarrollar recursos inform\u00e1ticos propios. El grupo de investigaci\u00f3n que dirigimos cuenta con investigadores e investigadoras altamente capacitados y especializados y que actualmente es capaz de analizar \u00a0datos de gen\u00f3mica, transcript\u00f3mica, epigen\u00f3mica, prote\u00f3mica, etc, para ofrecer a la comunidad cient\u00edfica una visi\u00f3n integral de la biolog\u00eda, caminando as\u00ed hacia una biolog\u00eda de sistemas<\/em>\u201d. Resalta Salas que \u201c<em>es un lujo contar en Galicia con los recursos y la ayuda inestimable del Centro de Supercomputaci\u00f3n de Galicia (CESGA) y que adem\u00e1s usamos sistem\u00e1ticamente en nuestro trabajo. Igualmente para agilizar muchos procesos computacionales asociados a estas plataformas hemos necesitado instalar localmente nuestros propios recursos de computaci\u00f3n, ya que de otro modo no ser\u00eda viable trabajar con toda esta infraestructura<\/em>\u201d.<\/p>\n<p>El grupo de investigaci\u00f3n dirigido por Salas y Martin\u00f3n desarrolla proyectos de investigaci\u00f3n con instituciones internacionales, como el Imperial College London, Genomic Institute of Singapore, Oxford Gene Technology, Ospidale Pediatico Bambino Ges\u00fa, PENTA Fondazione, Oxford University, Bristol University, etc, y tambi\u00e9n a nivel nacional, como con el Centro Superior de Investigaciones Cient\u00edficas (CSIC), la Universitat Aut\u00f2noma de Barcelona (UAB), el Centro de Investigaci\u00f3n Biom\u00e9dica en Red de Enfermedades Respiratorias (CIBERES), o la Direcci\u00f3 Cl\u00ednica Territorial de Malalties Infeccioses i Salut Internacional entre otros.<\/p>\n<p>Salas y Martin\u00f3n destacan la labor de sus cient\u00edficos y cient\u00edficas y analistas de datos en el grupo, empezando por Alberto G\u00f3mez Carballa y el grupo multidisciplinar conformado por Xabier Bello Paderne, Jacobo Pardo Seco, Sara Pischedda, Juli\u00e1n Montoto Louzao, Isabel Ferreir\u00f3s Vidal, Sandra Viz Lasheras, Narmeen Mallah y Mar\u00eda Jos\u00e9 Curr\u00e1s. El grupo suma m\u00e1s de 40 investigadores con un factor de impacto cient\u00edfico acumulado por encima de 5.000, generando m\u00e1s de 20 publicaciones cada a\u00f1o, y participando al m\u00e1ximo nivel en la primera l\u00ednea de investigaci\u00f3n aplicada en infecciones y vacunas. \u201c<em>Todos y cada uno de ellos y ellas son fundamentales para que todas las actividades de investigaci\u00f3n funcionen de manera orquestada<\/em>\u201d, afirman Salas y Martin\u00f3n.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>El Instituto de Investigaci\u00f3n Sanitaria de Santiago de Compostela, IDIS, adquiere tecnolog\u00eda de vanguardia para \u2018transcribir\u2019 la parte funcional del genoma, que ejecuta las funciones en el cuerpo de un ser vivo<\/p>\n","protected":false},"author":16,"featured_media":23150,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_et_pb_use_builder":"","_et_pb_old_content":"","_et_gb_content_width":"","inline_featured_image":false,"footnotes":""},"categories":[1,332,521,529,610],"tags":[232,797,808,809,810,811],"class_list":["post-23149","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-noticias","category-carrusel-de-portada","category-carrusel-en-ingles","category-carrusel-en-galego","category-investigacion","tag-idis-2","tag-genomica","tag-tecnologia","tag-transcriptomica","tag-nanostring","tag-equipo-de-investigacion"],"publishpress_future_workflow_manual_trigger":{"enabledWorkflows":[]},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/23149","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/16"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=23149"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/23149\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":23159,"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/23149\/revisions\/23159"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/media\/23150"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=23149"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=23149"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.idisantiago.es\/gl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=23149"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}