E055 – Predisposición al cáncer y biomarcadores

Objetivos

El objetivo principal del grupo de Predisposición al Cáncer y Biomarcadores es la caracterización de los factores genéticos del cáncer. Esta información es de particular relevancia a la hora de dilucidar los mecanismos biológicos responsables de la aparición de tumores, lo cual es esencial para el desarrollo de nuevas terapias. Además, nos permiten idear estrategias de estratificación de riesgo que podrían ser usadas para complementar los programas de cribado poblacional actuales.

Líneas de investigación

El trabajo del grupo de Predisposición al Cáncer y biomarcadores está focalizado en el análisis de cómo la genómica junto a otros datos ómicos pueden ser utilizados para identificar a aquellos individuos más susceptibles de desarrollar cáncer, principalmente en el ámbito del cáncer colorrectal. Para ello, utilizamos herramientas como los GWAS, TWAS y MWAS, que nos permiten identificar los genes responsables del desarrollo de esta enfermedad. Otras líneas de trabajo en las que participamos actualmente incluyen la intersección entre la transcriptómica de célula única y las aproximaciones de biopsia líquida en varios tipos de tumores, las medidas transcriptómicas y genómicas de respuesta a inmunoterapia, el estudio de los mecanismos responsables de la aparición de resistencias a tratamiento en células madre de cáncer o la predisposición genética a la aparición de reacciones adversas a fármacos quimioterapéuticos.

Líder
Fernández Rozadilla, Ceres

• Bonjoch L; Fernandez-Rozadilla C; Alvarez-Barona M; et al; Ruiz-Ponte C. BMPR2 as a Novel Predisposition Gene for Hereditary Colorectal Polyposis, Gastroenterology (2023), doi: 10.1053/j.gastro.2023.03.006.
• Fernandez-Rozadilla C, Timofeeva M, Chen Z, Law P, Thomas M, Schmit S, Díez-Obrero V, Hsu L, Fernandez-Tajes J, Palles C, Sherwood K, Briggs S, Svinti V, Donnelly K, Farrington S, Blackmur J, Vaughan-Shaw P, Shu XO, Long J, Cai Q, Guo X, Lu Y, Broderick P, Studd J, Huyghe J, Harrison T, Conti D, Dampier C, Devall M, Schumacher F, Melas M, Rennert G, Obón-Santacana M, Martín-Sánchez V, Moratalla-Navarro F, Oh JH, Kim J, Jee SH, Jung KJ, Kweon SS, Shin MH, Shin A, Ahn YO, Kim DH, Oze I, Wen W, Matsuo K, Matsuda K, Tanikawa C, Ren Z, Gao YT, Jia WH, Hopper J, Jenkins M, Win AK, Pai R, Figueiredo J, Haile R, Gallinger S, Woods M, Newcomb P, Duggan D, Cheadle J, Kaplan R, Maughan T, Kerr R, Kerr D, Kirac I, Böhm J, Mecklin LP, Jousilahti P, Knekt P, Aaltonen L, Rissanen H, Pukkala E, Eriksson J, Cajuso T, Hänninen U, Kondelin J, Palin K, Tanskanen T, Renkonen-Sinisalo L, Zanke B, Männistö S, Albanes D, Weinstein S, Ruiz-Narvaez E, Palmer J, Buchanan D, Platz E, Visvanathan K, Ulrich C, Siegel E, Brezina S, Gsur A, Campbell P, Chang-Claude J, Hoffmeister M, Brenner H, Slattery M, Potter J, Tsilidis K, Schulze M, Gunter M, Murphy N, Castells A, Castellví-Bel S, Moreira L, Arndt V, Shcherbina A, Stern M, Pardamean B, Bishop T, Giles G, Southey M, Idos G, McDonnell K, Abu-Ful Z, Greenson J, Shulman K, Lejbkowicz F, Offit K, Su YR, Steinfelder R, Keku T, van Guelpen B, Hudson T, Hampel H, Pearlman R, Berndt S, Hayes R, Martinez ME, Thomas S, Corley D, Pharoah P, Larsson S, Yen Y, Lenz HJ, White E, Li L, Doheny K, Pugh E, Shelford T, Chan A, Cruz-Correa M, Lindblom A, Hunter D, Joshi A, Schafmayer C, Scacheri P, Kundaje A, Nickerson D, Schoen R, Hampe J, Stadler Z, Vodicka P, Vodickova L, Vymetalkova V, Papadopoulos N, Edlund C, Gauderman W, Thomas D, Shibata D, Toland A, Markowitz S, Kim A, Chanock S, van Duijnhoven F, Feskens E, Sakoda L, Gago-Dominguez M, Wolk A, Naccarati A, Pardini B, FitzGerald L, Lee SC, Ogino S, Bien S, Kooperberg C, Li C, Lin Y, Prentice R, Qu C, Bézieau S, Tangen C, Mardis E, Yamaji T, Sawada N, Iwasaki M, Haiman C, Le Marchand L, Wu A, Qu C, McNeil C, Coetzee G, Hayward C, Deary I, Harris S, Theodoratou E, Reid S, Walker M, Ooi LY, Moreno V, Casey G, Gruber S, Tomlinson I, Zheng W, Dunlop M, Houlston R, Peters U. Deciphering colorectal cancer genetics through multi-omic analysis of 100,204 cases and 154,587 controls of European and east Asian ancestries. Nat Genet. 2022, 55, 89–99 (2023). doi: 10.1038/s41588-022-01222-9.
• Fernández-Rozadilla C, Álvarez-Barona M, Quintana I, López-Novo A, Amigo J, Cameselle-Teijeiro JM, Roman E, Gonzalez D, Llor X, Bujanda L, Bessa X, Jover R, Balaguer F, Castells A, Castellví-Bel S, Capellá G, Carracedo A, Valle L, Ruiz-Ponte C. Exome sequencing of early-onset patients supports genetic heterogeneity in colorectal cancer. Sci Rep. 2021 May 27;11(1):11135. doi: 10.1038/s41598-021-90590-z.
• Fernandez-Rozadilla C, Simões AR, Lleonart ME, Carnero A, Carracedo Á. Tumor Profiling at the Service of Cancer Therapy. Front Oncol. 2021 Jan 11;10:595613. doi: 10.3389/fonc.2020.595613.
• Simões AR, Fernández-Rozadilla C, Maroñas O, Carracedo Á. The Road so Far in Colorectal Cancer Pharmacogenomics: Are We Closer to Individualised Treatment? J Pers Med. 2020 Nov 19;10(4):237. doi: 10.3390/jpm10040237.
• Fernandez-Rozadilla C, Alvarez-Barona M, Schamschula E, Bodo S, Lopez-Novo A, Dacal A, Calviño-Costas C, Lancho A, Amigo J, Bello X, Cameselle-Teijeiro JM, Carracedo A, Colas C, Muleris M, Wimmer K, Ruiz-Ponte C. Early Colorectal Cancers Provide New Evidence for a Lynch Syndrome-to-CMMRD Phenotypic Continuum. Cancers (Basel). 2019 Jul 30;11(8):1081. doi: 10.3390/cancers1108108. 
• Law PJ, Timofeeva M, Fernandez-Rozadilla C, […], Dunlop MG. Association analyses identify 31 new risk loci for colorectal cancer susceptibility. Nat Commun. 2019 May 14;10(1):2154. doi: 10.1038/s41467-019-09775-w.
• Fernandez-Rozadilla C, Kartsonaki C, Woolley C, McClellan M, Whittington D, Horgan G, Leedham S, Kriaucionis S, East J, Tomlinson I. Telomere length and genetics are independent colorectal tumour risk factors in an evaluation of biomarkers in normal bowel. Br J Cancer. 2018 Mar 6;118(5):727-732. doi: 10.1038/bjc.2017.486. Erratum in: Br J Cancer. 2018 Jun;118(12):1683. doi: 10.1038/s41416-018-0111-0.