Detección Molecular Digital Directa (Nanostring)

El equipamiento nCounter MAX de Nanostring ofrece una serie de ventajas sobre la versión anterior (SPRINT Profiler), y permite mejorar tiempos de análisis eliminando los principales cuellos de botella en el procesado de muestras y obtención de datos para proyectos o estudios. Además, permite detectar pequeños cambios estructurales en el plegamiento.

Elimina la síntesis, amplificación y preparación de bibliotecas de cDNA para reducir variaciones técnicas en el ensayo y reduce la necesidad de réplicas experimentales.

El sistema de análisis nCounter® permite analizar cientos de mRNAs, miRNAs, SNV, CNV o proteínas directamente mediante detección molecular digital directa, en una sola reacción en ausencia de enzimas (sin retrotranscripción ni amplificación). Es un sistema de alta sensibilidad y reproducibilidad, con gran capacidad de multiplexado (hasta 800 genes en la misma reacción), lo cual no solo disminuye el número de reacciones necesarias, sino que también supone un ahorro en la cantidad de RNA/DNA que se requiere para el ensayo.

La tecnología

En esta tecnología, cada molécula diana viene identificada por un “código de barras” molecular formado por la combinación secuencial de seis unidades de fluorocromos de cuatro colores distintos. Estos códigos de barras hibridan directamente con las moléculas de interés, y pueden ser cuantificadas individualmente sin ser necesaria la amplificación de las muestras, proporcionando así datos digitales con una gran sensibilidad. Cada “Código de Barras” se une a una molécula diana individual y específica, de manera que logramos medir la cantidad real de moléculas diana existentes en una muestra.

Ventajas de la tecnología

• Rapidez: No requiere de ningún tipo de reacción enzimática (ni amplificación, obtención de cDNA ni preparación de librerías). Por lo tanto, evita la variación de tipo técnico y, por consiguiente, un posible sesgo en los resultados.

• Requiere poca cantidad de RNA: por lo que el ahorro de muestra es considerable.

• Alta precisión, sensibilidad y reproducibilidad: precisión superior a la de una qPCR y sin necesidad de hacer réplicas técnicas. La correlación entre réplicas técnicas excede 0.99. La precisión y sensibilidad se mantiene incluso con niveles bajos de expresión.
• Versatilidad: la química es altamente tolerante a tipos de muestra difíciles. Al no requerir enzimas, el sistema puede trabajar con una gran variedad de tipos y calidades de muestras, siendo posible incluso obtener resultados óptimos a partir de muestras parafinadas (FFPE) donde el material de partida está muy degradado, o incluso puede trabajar con lisados celulares sin necesidad de llevar a cabo una extracción de ARN.

• Capacidad de multiplexado: analiza cientos de targets en un solo tubo (hasta 800 genes). Posibilidad de usar paneles pre-diseñados o construir paneles custom a medida con las dianas de interés

• Tratamiento de datos sencillo: salida de datos en formato csv. Los datos pueden ser exportados y explotados con softwares de uso habitual.

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Tarifas sin IVA.