Proteómica
PLATAFORMAS DE APOYO COMÚN
Equipamiento
- MALDI-TOF/TOF (4800 Analyzer, AbSciex)
- Espectrómetro de masas Triple TOF 6600 (Sciex) acoplado a un Nano HPLC 420 (eksigen) con una fuente de ionización dual y espectrómetro de masas Triple TOF 6600plus (Sciex) acoplado a un Nano HPLC 425 (eksigen) con una fuente de ionización Optiflow
- Sala blanca
Descripción
La plataforma de Proteómica fue creada con el objetivo de potenciar la investigación, dar soporte y ofrecer a los investigadores una infraestructura completa en el campo de la proteómica manejada por personal altamente especializado.
Está dotada con equipos de última generación que permiten realizar estudios tanto de caracterización de proteomas completos, como de análisis de expresión diferencial. Teniendo en cuenta que la causa de la mayoría de las enfermedades humanas se debe a la desregulación funcional de la interacción entre proteínas, la aplicación clínica más importante sería la búsqueda y posterior identificación de biomarcadores de las distintas patologías.
El trabajo de la Plataforma se centra en la separación, identificación, cuantificación y caracterización de proteínas en sistemas biológicos mediante cromatografía líquida multidimensional y análisis de proteómica basada en espectrometría de masas. Nuestro laboratorio está especializado en una amplia gama de enfoques para respaldar estudios relacionados con el proteoma, desde la identificación y cuantificación de proteínas individuales hasta el análisis complejo de muestras en diferentes sistemas biológicos. Además, la plataforma colabora con otros grupos en la investigación y búsqueda de diseños experimentales apropiados, ayudando en la escritura de los paper, análisis y validación de resultados, entre otros.
Por otro lado, además de nuestra principal línea de trabajo como servicio, también realizamos nuestra propia investigación, desarrollando trabajos enfocados en la optimización de protocolos, la actualización de los equipos y la introducción de nuevas técnicas para ofrecer los servicios más completos y novedosos.
Servicios
- Determinación De Masas Moleculares (DDM).
- Identificación de proteínas mediante huella peptídica (MALDI-TOF).
- Identificación de mezclas de proteínas mediante nanoLC-MALDI-TOF/TOF.
- Identificación masiva de proteínas por métodos LC-MSMS (métodos DDA usando un equipo Triple TOF).
- Cromatografía en fase reversa (Nano-HPLC).
- Separación de proteínas mediante electroforesis monodimensional (SDS-PAGE).
- Separación de proteínas mediante Electroforesis Bidimensional (2-DE).
- Proteómica Diferencial con marcaje· 2D-DIGE, ITRAQ, SILAC.
- Proteómica Diferencial sin marcaje “label free” SWATH.
- Modificaciones Postraduccionales (PTM) ·fosforilaciones, glicosilaciones, glicaciones…
- Manejo de distintos programas para el análisis de datos: ProteinPilot para la identificación de proteínas; Peak View, Marker View y Skyline para la cuantificación de proteínas…PEAKS para estudio de modificaciones posttraduccionales y Secuenciación de Novo.
- Otros servicios:
-Escaneado de geles
-Preparación de muestras
-Asesoramiento en el diseño experimental de análisis proteómicos
-Análisis de datos en bases informáticas
Tarifas
Tarifa Interna IDIS | Tarifa Organismos Públicos | Tarifa Organismos Privados | |
---|---|---|---|
Preparación de muestras-precipitación (por muestra) | 12,0 € | 15,0 € | 18,0 € |
Preparación-desalado/concentración fase reversa (C18) | 13,0 € | 16,0 € | 19,0 € |
Preparación-desalado/concentración centrifugación (CENTRICON) | 13,0 € | 18,0 € | 20,0 € |
Preparación-cuantificación proteína (RC-DC) | 30,0 € | 39,0 € | 45,0 € |
Depleción | 22,0 € | 29,0 € | 33,0 € |
Digestión solución | 23,0 € | 29,0 € | 34,0 € |
Digestion gel | 23,0 € | 30,0 € | 34,0 € |
Determinación de masas moleculares | 9,0 € | 12,0 € | 14,0 € |
Identificación por huella peptídica-hasta 10 muestras | 19,0 € | 25,0 € | 29,0 € |
Identificación por huella peptídica-de 11 a 50 muestras | 17,0 € | 22,0 € | 25,0 € |
Identificación por huella peptídica-más de 51 muestras | 17,0 € | 22,0 € | 25,0 € |
Fragmentación MS/MS | 2,0 € | 3,0 € | 3,0 € |
Secuenciación de Novo MALDI | 71,0 € | 93,0 € | 107,0 € |
Secuenciación de Novo Triple TOF | 147,0 € | 200,0 € | 220,0 € |
LC-MS/MS TRIPLE TOF - Gradiente ultracorto (15 minutos) | 44,0 € | 53,0 € | 61,0 € |
LC-MS/MS TRIPLE TOF - Gradiente corto (40 minutos) | 86,0 € | 141,0 € | 163,0 € |
LC-MS/MS TRIPLE TOF - Gradiente medio (75 minutos) | 127,0 € | 221,0 € | 255,0 € |
LC-MS/MS TRIPLE TOF - Gradiente largo (95 minutos) | 183,0 € | 466,0 € | 537,0 € |
Modificaciones | postraduccionales | ||
Estudio modificaciones postraduccionales (TiO2)* | 70,0 € | 91,0 € | 105,0 € |
Estudio modificaciones postraduccionales (FeNTA/IMAC)* | 70,0 € | 91,0 € | 105,0 € |
Estudio modificaciones postraduccionales (Sumoilaciones con enriquecimiento con kit comercial)* | 77,0 € | 93,1 € | 115,5 € |
Puesta a punto PRM/SRM/MRM* | 164,0 € | 213,0 € | 246,0 € |
Análisis por muestra | 44,0 € | 53,0 € | 61,0 € |
Proteómica | cuantitativa | basada en gel | |
DIGE - Proteómica quantitativa | 278,0 € | 362,0 € | 417,0 € |
Electroforesis | bidimensional | ||
2D-PAGE (7cm) | 24,0 € | 31,0 € | 36,0 € |
2D-PAGE (de 11 a 21 cm) | 131,0 € | 170,0 € | 196,0 € |
Tinción Coomassie | 2,0 € | 3,0 € | 4,0 € |
Tinción Sypro | 10,0 € | 13,0 € | 15,0 € |
Tinción plata | 4,0 € | 5,0 € | 6,0 € |
Western Blot* | 90,0 € | 117,0 € | 135,0 € |
Elisa* | 100,0 € | 130,0 € | 150,0 € |
Análisis | datos | ||
Procesado de muestras (hora) | 20,0 € | 26,0 € | 30,0 € |
Tarifas sin IVA.
Estudio de Modificaciones Postraduccionales PTM*
Los analisis de PTMs* solo incluyen el enriquecimiento, el análisis por masas se cobrará aparte.
Western-Blot* incluye:
Transferencia de proteínas a membrana de Nitrocelulosa.
Bloqueo de membrana, incubaciones con anticuerpos y revelado por ECL.
Digitalización de la membrana y cuantificación de las bandas de interés.
El anticuerpo primario se facturará por separado.
Elisa* incluye :
Preparación de la placa.
Realización del Elisa y lectura.
Análisis
El Kit de Elisa se facturará aparte
PRM* incluye :
Puesta a punto del método.
Los péptidos se facturarán por separado.
Se necesitan entre 2 y 4 péptidos sin marcar (115 euros de media por cada uno).
Aconsejado 2 péptidos marcados (500 euros de media por péptido).
Contacto
Susana B. Bravo López