Proteómica

Está dotada con equipos de última generación que permiten realizar estudios tanto de caracterización de proteomas completos, como de análisis de expresión diferencial. Teniendo en cuenta que la causa de la mayoría de las enfermedades humanas se debe a la desregulación funcional de la interacción entre proteínas, la aplicación clínica más importante sería la búsqueda y posterior identificación de biomarcadores de las distintas patologías.

El trabajo de la Plataforma se centra en la separación, identificación, cuantificación y caracterización de proteínas en sistemas biológicos mediante cromatografía líquida multidimensional y análisis de proteómica basada en espectrometría de masas. Nuestro laboratorio está especializado en una amplia gama de enfoques para respaldar estudios relacionados con el proteoma, desde la identificación y cuantificación de proteínas individuales hasta el análisis complejo de muestras en diferentes sistemas biológicos. Además, la plataforma colabora con otros grupos en la investigación y búsqueda de diseños experimentales apropiados, ayudando en la escritura de los paper, análisis y validación de resultados, entre otros.

Por otro lado, además de nuestra principal línea de trabajo como servicio, también realizamos nuestra propia investigación, desarrollando trabajos enfocados en la optimización de protocolos, la actualización de los equipos y la introducción de nuevas técnicas para ofrecer los servicios más completos y novedosos.

• Determinación De Masas Moleculares (DDM).
• Identificación de proteínas mediante huella peptídica (MALDI-TOF).
• Identificación de mezclas de proteínas mediante nanoLC-MALDI-TOF/TOF.
• Identificación masiva de proteínas por métodos LC-MSMS (métodos DDA usando un equipo Triple TOF).
• Cromatografía en fase reversa (Nano-HPLC).
• Separación de proteínas mediante electroforesis monodimensional (SDS-PAGE).
• Separación de proteínas mediante Electroforesis Bidimensional (2-DE).
• Proteómica Diferencial con marcaje· 2D-DIGE, ITRAQ, SILAC.
• Proteómica Diferencial sin marcaje “label free” SWATH.
• Modificaciones Postraduccionales (PTM) ·fosforilaciones, glicosilaciones, glicaciones…
• Manejo de distintos programas para el análisis de datos: ProteinPilot para la identificación de proteínas; Peak View, Marker View y Skyline para la cuantificación de proteínas…PEAKS para estudio de modificaciones posttraduccionales y Secuenciación de Novo.
• Otros servicios:
  -Escaneado de geles
  -Preparación de muestras
  -Asesoramiento en el diseño experimental de análisis proteómicos
  -Análisis de datos en bases informáticas

Tarifas sin IVA.

Estudio de Modificaciones Postraduccionales PTM*
Los analisis de PTMs* solo incluyen el enriquecimiento, el análisis por masas se cobrará aparte.

Western-Blot* incluye:
Transferencia de proteínas a membrana de Nitrocelulosa.
Bloqueo de membrana, incubaciones con anticuerpos y revelado por ECL.
Digitalización de la membrana y cuantificación de las bandas de interés.
El anticuerpo primario se facturará por separado.

Elisa* incluye :
Preparación de la placa.
Realización del Elisa y lectura.
Análisis
El Kit de Elisa se facturará aparte

PRM* incluye :
Puesta a punto del método.
Los péptidos se facturarán por separado.
Se necesitan entre 2 y 4 péptidos sin marcar (115 euros de media por cada uno).
Aconsejado 2 péptidos marcados (500 euros de media por péptido).

• Nóvoa E, da Silva Lima N, Gonzalez-Rellan MJ, Chantada-Vazquez MDP, Verheij J, Rodriguez A, Esquinas-Roman EM, Fondevila MF, Koning M, Fernandez U, Cabaleiro A, Parracho T, Iglesias-Moure J, Seoane S, Porteiro B, Escudero A, Senra A, Perez-Fernandez R, López M, Fidalgo M, Guallar D, Martinez-Chantar ML, Dieguez C, Varela-Rey M, Prevot V, Schwaninger M, Meijnikman A, Bravo SB, Frühbeck G, Nogueiras R. Mitochondrial antiviral signaling protein enhances MASLD progression via the ERK/TNFα/NFκβ pathway. Hepatology. 2024 May 16. doi: 10.1097/HEP.0000000000000930. Epub ahead of print. PMID: 38761407.
• Rodrigues JS, Chenlo M, Bravo SB, Perez-Romero S, Suarez-Fariña M, Sobrino T, Sanz-Pamplona R, González-Prieto R, Blanco Freire MN, Nogueiras R, López M, Fugazzola L, Cameselle-Teijeiro JM, Alvarez CV. dsRNAi-mediated silencing of PIAS2beta specifically kills anaplastic carcinomas by mitotic catastrophe. Nat Commun. 2024 May 14;15(1):3736. doi: 10.1038/s41467-024-47751-1. PMID: 38744818; PMCID: PMC11094195.
• Feás X, Alonso-Sampedro M, Bravo SB, Vidal C. Peeking into the Stingers: A Comprehensive SWATH-MS Study of the European Hornet Vespa crabro (Linnaeus, 1758) (Hymenoptera: Vespidae) Venom Sac Extracts. Int J Mol Sci. 2024 Mar 28;25(7):3798. doi: 10.3390/ijms25073798. PMID: 38612607; PMCID: PMC11011553.
• Álvarez JV, Bravo SB, Chantada-Vázquez MP, Pena C, Colón C, Tomatsu S, Otero- Espinar FJ, Couce ML. Morquio A Syndrome: Identification of Differential Patterns of Molecular Pathway Interactions in Bone Lesions. Int J Mol Sci. 2024 Mar 12;25(6):3232. doi: 10.3390/ijms25063232. PMID: 38542208; PMCID: PMC10970612.
• Aragón-Herrera A, Feijóo-Bandín S, Vázquez-Abuín X, Anido-Varela L, Moraña-Fernández S, Bravo SB, Tarazón E, Roselló-Lletí E, Portolés M, García-Seara J, Seijas J, Rodríguez-Penas D, Bani D, Gualillo O, González-Juanatey JR, Lago F. Human recombinant relaxin-2 (serelaxin) regulates the proteome, lipidome, lipid metabolism and inflammatory profile of rat visceral adipose tissue. Biochem Pharmacol. 2024 May;223:116157. doi: 10.1016/j.bcp.2024.116157. Epub 2024 Mar 20. PMID: 38518995.
• López-Valverde L, Vázquez-Mosquera ME, Colón-Mejeras C, Bravo SB, Barbosa-Gouveia S, Álvarez JV, Sánchez-Martínez R, López-Mendoza M, López-Rodríguez M, Villacorta-Argüelles E, Goicoechea-Diezhandino MA, Guerrero-Márquez FJ, Ortolano S, Leao-Teles E, Hermida-Ameijeiras Á, Couce ML. Characterization of the plasma proteomic profile of Fabry disease: Potential sex- and clinical phenotype-specific biomarkers. Transl Res. 2024 Jul;269:47-63. doi: 10.1016/j.trsl.2024.02.006. Epub 2024 Feb 21. PMID: 38395389.
• Pazos-Pérez A, Piñeiro-Ramil M, Franco-Trepat E, Alonso-Pérez A, Guillán-Fresco M, Crespo-Golmar A, López-Fagúndez M, Aranda JC, Bravo SB, Jorge-Mora A, Gómez R. The Hepatokine RBP4 Links Metabolic Diseases to Articular Inflammation. Antioxidants (Basel). 2024 Jan 19;13(1):124. doi: 10.3390/antiox13010124. PMID: 38275649; PMCID: PMC10812991.
• García-Vega D, Sánchez-López D, Rodríguez-Carnero G, Villar-Taibo R, Viñuela JE, Lestegás-Soto A, Seoane-Blanco A, Moure-González M, Bravo SB, Fernández ÁL, González-Juanatey JR, Eiras S. Semaglutide modulates prothrombotic and
  atherosclerotic mechanisms, associated with epicardial fat, neutrophils and endothelial cells network. Cardiovasc Diabetol. 2024 Jan 3;23(1):1. doi: 10.1186/s12933-023-02096-9. PMID: 38172989; PMCID: PMC10765851.