Proteómica

A plataforma de Proteómica foi creada co obxectivo de potenciar a investigación, dar soporte e ofrecer aos investigadores unha infraestrutura completa no campo da proteómica manexada por persoal altamente especializado.

Está dotada con equipos de última xeración que permiten realizar estudos tanto de caracterización de proteomas completos, como de análise de expresión diferencial. Tendo en conta que a causa da maioría das enfermidades humanas débese á desregulación funcional da interacción entre proteínas, a aplicación clínica máis importante sería a busca e posterior identificación de biomarcadores das distintas patoloxías.

O traballo da Plataforma céntrase na separación, identificación, cuantificación e caracterización de proteínas en sistemas biolóxicos mediante cromatografía líquida multidimensional e análise de proteómica basada en espectrometría de masas. O noso laboratorio está especializado nunha amplia gama de enfoques para respaldar estudos relacionados co proteoma, desde a identificación e cuantificación de proteínas individuais ata a análise complexa de mostras en diferentes sistemas biolóxicos. Ademáis, a plataforma colabora con outros grupos na investigación e busca de deseños experimentais apropiados, axudando na escritura dos paper, análise e validación de resultados, entre outros.

Por outro lado, ademáis da nosa principal liña de traballo como servizo, tamén realizamos a nosa propia investigación, desenvolvendo traballos enfocados na optimización de protocolos, a actualización dos equipos e a introdución de novas técnicas para ofrecer os servizos máis completos e novidosos.

• Determinación De Masas Moleculares (DDM).
• Identificación de proteínas mediante pegada peptídica (MALDI-TOF).
• Identificación de misturas de proteínas mediante nanoLC-MALDI-TOF/TOF.
• Identificación masiva de proteínas por métodos LC-MSMS (métodos DDA usando un equipo Triple TOF).
• Cromatografía en fase reversa (Nano-HPLC).
• Separación de proteínas mediante electroforesie monodimensional (SDS-PAGE).
• Separación de proteínas mediante Electroforese Bidimensional (2-DE).
• Proteómica Diferencial con marcaxe· 2D-DIGE, ITRAQ, SILAC.
• Proteómica Diferencial sen marcaxe “label free” SWATH.
• Modificacións Postraduccionais (PTM) ·fosforilacións, glicosilacións, glicacións…
• Manexo de distintos programas para a análise de datos: ProteinPilot para a identificación de proteínas; Peak View, Marker View y Skyline para a cuantificación de proteínas…PEAKS para estudo de modificacións posttraduccionais e Secuenciación de Novo.
• Outros servizos:
  -Escaneado de xeles
  -Preparación de mostras
  -Asesoramento no deseño experimental de análiss proteómicos
  -Análises de datos en bases informáticas

Tarifas sin IVE.

• Nóvoa E, da Silva Lima N, Gonzalez-Rellan MJ, Chantada-Vazquez MDP, Verheij J, Rodriguez A, Esquinas-Roman EM, Fondevila MF, Koning M, Fernandez U, Cabaleiro A, Parracho T, Iglesias-Moure J, Seoane S, Porteiro B, Escudero A, Senra A, Perez-Fernandez R, López M, Fidalgo M, Guallar D, Martinez-Chantar ML, Dieguez C, Varela-Rey M, Prevot V, Schwaninger M, Meijnikman A, Bravo SB, Frühbeck G, Nogueiras R. Mitochondrial antiviral signaling protein enhances MASLD progression via the ERK/TNFα/NFκβ pathway. Hepatology. 2024 May 16. doi: 10.1097/HEP.0000000000000930. Epub ahead of print. PMID: 38761407.
• Rodrigues JS, Chenlo M, Bravo SB, Perez-Romero S, Suarez-Fariña M, Sobrino T, Sanz-Pamplona R, González-Prieto R, Blanco Freire MN, Nogueiras R, López M, Fugazzola L, Cameselle-Teijeiro JM, Alvarez CV. dsRNAi-mediated silencing of PIAS2beta specifically kills anaplastic carcinomas by mitotic catastrophe. Nat Commun. 2024 May 14;15(1):3736. doi: 10.1038/s41467-024-47751-1. PMID: 38744818; PMCID: PMC11094195.
• Feás X, Alonso-Sampedro M, Bravo SB, Vidal C. Peeking into the Stingers: A Comprehensive SWATH-MS Study of the European Hornet Vespa crabro (Linnaeus, 1758) (Hymenoptera: Vespidae) Venom Sac Extracts. Int J Mol Sci. 2024 Mar 28;25(7):3798. doi: 10.3390/ijms25073798. PMID: 38612607; PMCID: PMC11011553.
• Álvarez JV, Bravo SB, Chantada-Vázquez MP, Pena C, Colón C, Tomatsu S, Otero- Espinar FJ, Couce ML. Morquio A Syndrome: Identification of Differential Patterns of Molecular Pathway Interactions in Bone Lesions. Int J Mol Sci. 2024 Mar 12;25(6):3232. doi: 10.3390/ijms25063232. PMID: 38542208; PMCID: PMC10970612.
• Aragón-Herrera A, Feijóo-Bandín S, Vázquez-Abuín X, Anido-Varela L, Moraña-Fernández S, Bravo SB, Tarazón E, Roselló-Lletí E, Portolés M, García-Seara J, Seijas J, Rodríguez-Penas D, Bani D, Gualillo O, González-Juanatey JR, Lago F. Human recombinant relaxin-2 (serelaxin) regulates the proteome, lipidome, lipid metabolism and inflammatory profile of rat visceral adipose tissue. Biochem Pharmacol. 2024 May;223:116157. doi: 10.1016/j.bcp.2024.116157. Epub 2024 Mar 20. PMID: 38518995.
• López-Valverde L, Vázquez-Mosquera ME, Colón-Mejeras C, Bravo SB, Barbosa-Gouveia S, Álvarez JV, Sánchez-Martínez R, López-Mendoza M, López-Rodríguez M, Villacorta-Argüelles E, Goicoechea-Diezhandino MA, Guerrero-Márquez FJ, Ortolano S, Leao-Teles E, Hermida-Ameijeiras Á, Couce ML. Characterization of the plasma proteomic profile of Fabry disease: Potential sex- and clinical phenotype-specific biomarkers. Transl Res. 2024 Jul;269:47-63. doi: 10.1016/j.trsl.2024.02.006. Epub 2024 Feb 21. PMID: 38395389.
• Pazos-Pérez A, Piñeiro-Ramil M, Franco-Trepat E, Alonso-Pérez A, Guillán-Fresco M, Crespo-Golmar A, López-Fagúndez M, Aranda JC, Bravo SB, Jorge-Mora A, Gómez R. The Hepatokine RBP4 Links Metabolic Diseases to Articular Inflammation. Antioxidants (Basel). 2024 Jan 19;13(1):124. doi: 10.3390/antiox13010124. PMID: 38275649; PMCID: PMC10812991.
• García-Vega D, Sánchez-López D, Rodríguez-Carnero G, Villar-Taibo R, Viñuela JE, Lestegás-Soto A, Seoane-Blanco A, Moure-González M, Bravo SB, Fernández ÁL, González-Juanatey JR, Eiras S. Semaglutide modulates prothrombotic and
  atherosclerotic mechanisms, associated with epicardial fat, neutrophils and endothelial cells network. Cardiovasc Diabetol. 2024 Jan 3;23(1):1. doi: 10.1186/s12933-023-02096-9. PMID: 38172989; PMCID: PMC10765851.